La biblioteca è costituita da 4 Sezioni per un totale di 7 Sale di Consultazione e studio ubicate, secondo l'interesse, due presso la Facoltà (Istituti Biologici), tre presso il Policlinico Gemelli (Istituti Clinici) e due presso il Polo Universitario Giovanni XXIII.

Il materiale bibliografico relativo alla Facoltà di Medicina e chirurgia è collocato per materia secondo la classificazione della National Library of Medicine.

Il materiale é collocato a scaffale aperto con accessibilitá diretta da parte degli utenti, fatta eccezione del materiale piú datato (ante 2000) che trova collocazione presso un deposito esterno, disponibile su richiesta.

Per accedere alle Sale Istituti Biologici, Giovanni Scambia e Polo Universitario Giovanni XXIII è necessaria la prenotazione con Affluences.

Le opere a stampa, conservate localmente nelle singole biblioteche UCSC, possono essere richieste: 
- in consultazione l'opera può essere consultata solo nel giorno in cui l'utente la riceve, con obbligo di
restituzione entro l'orario di chiusura della biblioteca che la conserva

- in prestito – la durata delle opere prese in prestito varia in base alla tipologia di utente

È possibile ottenere una proroga per 15 giorni dei volumi già ricevuti in prestito, fino ad un massimo di 5 volte, se per essi non siano già pervenute alla Biblioteca prenotazioni da altri utenti. La proroga va richiesta nei 5 giorni prima della scadenza del prestito già in corso, tramite My Library, via e-mail o telefonicamente.

La prenotazione del testo decade automaticamente dopo 48 ore 

Per particolari ragioni di necessità, la Biblioteca potrà richiedere la restituzione in anticipo. La concessione del prestito è sospesa per chi non ha effettuato la restituzione entro i termini stabiliti ed il blocco del servizio è equivalente ai giorni di ritardo trascorsi nella restituzione.

Sono esclusi dal prestito i periodici, le opere di consultazione, i testi didattici, gli atlanti e tutto il materiale che nel catalogo contenga la dicitura "solo consultazione". Per questo materiale è possibile usufruire, nel rispetto delle norme legislative in materia di copyright, del servizio fotocopie.

Chi non restituisca alla Biblioteca un'opera avuta in prestito o consultazione, o la restituisca comunque danneggiata, è tenuto a sostituirla con un altro esemplare integro della stessa edizione. Qualora ciò non fosse possibile, è tenuto al rimborso di una somma di denaro pari al valore attuale dell'opera.
Per prenotare, richiedere o verificare la scadenza del materiale in prestito, è necessario autenticarsi in MY LIBRARY ovvero l’account nominale di Ateneo ( Come autenticarsi per i servizi della Biblioteca)

Prestito intersede tra Biblioteche UCSC
Il servizio permette di richiedere libri in prestito, fotocopie di articoli o di parti di volumi che, dopo una ricerca nel Catalogo d'Ateneo, risultano conservati solo in una biblioteca UCSC diversa dalla propria: Sono esclusi dal prestito intersede i periodici, le tesi, le enciclopedie e tutte quelle opere che devono rimanere costantemente a disposizione degli utenti per la sola consultazione.

Prestito EduCatt
Il Servizio Prestito intersede è stato ampliato con i libri di  EDUCatt , collocati presso la Biblioteca di Milano. Gli studenti potranno seguire la stessa procedura del  Prestito Intersede , oppure rivolgersi direttamente agli addetti della Biblioteca. Per visualizzare i titoli e le collocazioni nel "Catalogo classico" selezionare nel menù a tendina la voce "EDUCatt-Milano". La durata del prestito di un libro EDUCatt è di 60 giorni con possibilità di un prolungamento, per una sola volta, di 30 giorni.

Assistenza: E' possibile ricevere assistenza anche dai bibliotecari presenti nelle sale di consultazione e nei punti di distribuzione, oppure tramite il servizio  Chiedi al bibliotecario .