La biblioteca è costituita da 4 Sezioni per un totale di 8 Sale di Consultazione e studio ubicate, secondo l'interesse, due presso la Facoltà (Istituti Biologici), tre presso il Policlinico Gemelli (Istituti Clinici), due presso il Polo Universitario Giovanni XXIII e una nella Sezione distaccata di Campobasso, presso la struttura Gemelli Molise SpA.

Il materiale bibliografico relativo alla Facoltà di Medicina e chirurgia è collocato per materia secondo la classificazione della National Library of Medicine.

Il materiale é collocato a scaffale aperto con accessibilitá diretta da parte degli utenti, fatta eccezione del materiale piú datato (ante 2000) che trova collocazione presso un deposito esterno, disponibile su richiesta.

Per accedere alle Sale Istituti Biologici, Policlinico Gemelli e Polo Universitario Giovanni XXIII è necessaria la prenotazione con Affluences.